C'è un ceppo ibrido COVID dietro l'ultima ondata del Vietnam? Non esattamente

C'è un ceppo ibrido COVID dietro l'ultima ondata del Vietnam? Non esattamente

Di recente abbiamo sentito che è stata rilevata una nuova "variante ibrida" del coronavirus in Vietnam, in mezzo a un picco di casi nel paese.

La variante è stata originariamente descritta come un ibrido dei ceppi del virus del Regno Unito (ora Alpha) e indiano (ora Kappa B.1.617.1 e Delta B.1.617.2). Ma cosa significa questo in realtà? E se guardiamo alla scienza dietro il comportamento dei virus, è davvero un ibrido quello che stiamo vedendo?

Che cos'è un "ibrido"?

In virologia, il nome scientifico di un ibrido è "ricombinante". La ricombinazione è quando due ceppi infettano una persona contemporaneamente e combinare per fare un nuovo ceppo.

Questo processo è comune nell'influenza, dove viene spesso chiamato "spostamento antigenico".


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La principale preoccupazione con la ricombinazione virale è la possibilità che il nuovo ceppo emerga rapidamente con i vantaggi di entrambi i ceppi e si otterrà, ad esempio, un ceppo più trasmissibile e più veloce nella replicazione. Lo stesso può essere vero per la mutazione graduale, ma questo richiede più tempo.

Prove emergenti suggeriscono che i coronavirus possono subire ricombinazione, il che potrebbe aver contribuito a le origini della SARS-CoV-2, il virus che causa il COVID-19. c'è prova moderata La stessa SARS-CoV-2 ha subito una recente ricombinazione, con i primi rapporti che suggeriscono una possibile ricombinazione evento tra una variante Alpha (B.1.1.7) ed Epsilon (B.1.429).

È importante notare che questi rapporti sono in anticipo e parte della scienza è non ancora sottoposto a revisione paritaria. Quindi, il ruolo della ricombinazione nell'evoluzione di SARS-CoV-2 deve ancora essere confermato. Un grafico che rappresenta la ricombinazione rispetto alle mutazioni accumulate. Lara Herrero, Autore fornito

Secondo i primi rapporti dell'Organizzazione mondiale della sanità (OMS), il sequenziamento genetico mostra che il ceppo che circola in Vietnam è un ceppo Delta che si è sviluppato alcune ulteriori mutazioni.

Scientificamente, e Secondo l'OMS, questo significa che non è affatto un "ibrido". Piuttosto, è una versione mutata della variante Delta.

La variante Delta è stata originariamente rilevata in India e da allora si è diffusa in tutto il mondo, anche in Australia. I primi rapporti suggeriscono che è più trasmissibile e forse più mortale di altre varianti, portando le autorità sanitarie, anche in Vietnam, a essere in massima allerta.

Non conosciamo ancora i dettagli di quali mutazioni extra si trovano nella versione Vietnam della variante Delta. Ma abbiamo visto questo fenomeno prima, in cui le mutazioni note in una variante sono riportate come accumulanti in una diversa variante SARS-CoV-2. Un'infografica raffigurante la ricombinazione contro le mutazioni accumulate. La ricombinazione è quando due ceppi di un virus infettano una persona contemporaneamente e si combinano per formare un nuovo ceppo. Lara Herrero, creato utilizzando BioRender, autore fornito

Quello che sappiamo e non sappiamo

Alla fine del mese scorso, i funzionari sanitari vietnamiti hanno riferito che la circolazione di questa cosiddetta variante ibrida era molto pericolosa e più trasmissibile rispetto ad altri ceppi del virus. Hanno detto che era dietro il aumento delle infezioni Il Vietnam ha vissuto nel mese di maggio.

Questi rapporti iniziali erano basati su osservazioni cliniche. Non è ancora certo se questa variante mutata sia più infettiva e in che misura possa essere implicata nell'attuale ondata di infezioni in Vietnam.

Quando a qualcuno viene diagnosticato il COVID-19, non è sempre comune esibirsi sequenziamento dell'intero genoma sul loro campione virale. È spesso un processo costoso e dispendioso in termini di tempo intrapreso da funzionari della sanità pubblica, epidemiologi e virologi capire e prevedere il movimento di un focolaio.

Ciò significa che non tutti i paesi avranno la capacità di fornire rapidamente sequenze SARS-CoV-2 dell'intero genoma. Quindi i dettagli esatti di quale ceppo sta circolando e dove verranno sempre dopo i rapporti sui numeri dei casi.

È probabile che non sappiamo ancora se questo ceppo Delta alterato sia quello predominante in circolazione in Vietnam. Il Vietnam non ha ancora condotto un'analisi completa dei dati genomici da un numero sufficiente di campioni di pazienti o deve ancora rendere pubblicamente disponibili queste informazioni.

Inoltre, non sappiamo ancora se questa variante mutata sia più trasmissibile o causi COVID-19 più grave rispetto alla variante Delta o all'originale SARS-CoV-2. Inoltre, non sappiamo se influenzerà il funzionamento dei vaccini COVID.

Per rispondere a queste domande, avremo bisogno di dati genomici più dettagliati, tempo per vedere come vanno le cose nella comunità, nonché dati provenienti da studi scientifici e clinici che coinvolgono persone infette da questa variante.

Nuovi nomi

Mentre la pandemia di COVID-19 continua ad evolversi, anche i ceppi SARS-CoV-2 guidano il caos.

Inizialmente i rapporti si concentravano sul "variante del Regno Unito" o il "Variante indiana", e così via.

Riconoscendo la necessità di un sistema di denominazione universale, il L'OMS ha valutato la classificazione genomica dei ceppi e ha fornito nuovi nomi più generali basati sull'alfabeto greco.

Questo elenco include sia "varianti di interesse" che "varianti di interesse". Sebbene Delta sia classificato come una variante preoccupante, questa variante Delta alterata rilevata in Vietnam non è elencata in questa fase.

Per essere considerata una nuova variante del virus, o ceppo, una variante deve needs mostrano proprietà fisiche distinte, e quindi si comportano diversamente, dal virus originale o da un ceppo esistente. Dal punto di vista dell'OMS, questo non sembra essere il caso del ceppo Delta mutato. Almeno non ancora.

Un duro promemoria

Il Vietnam era un paese che si vantava di contenere il virus, con un successo iniziale nel controllo delle frontiere e nelle misure di salute pubblica. Ciò ha provocato periodi senza trasmissione comunitaria. Al momento, registra più di 200 nuovi casi al giorno (su Giugno 10 erano 413).

Ceppo ibrido o meno, la situazione del Vietnam dovrebbe ricordare al mondo – e in particolare a paesi come l'Australia, con un'analoga buona esperienza nel contenere il virus – della continua importanza del distanziamento sociale e della vaccinazione nella nostra lotta contro il COVID-19.

Circa l'autore

Lara Herrero, Responsabile della ricerca in virologia e malattie infettive, Griffith University
 
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Questo articolo è originariamente apparso su The Conversation

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